農委會為有效改善農業產區之農田排水，截至本 (105) 年 3 月止，已核定辦理的工程計 62 件，預計完成農田排水渠道長度約 54.7 公里及構造物 28 座，以維持汛期間農田排水路之暢通，提高田區積淹水排放能力，減輕農田淹水損害及縮短淹水時間；預計可改善約 52 平方公里重要農業高淹水潛勢地區之水患問題。
農委會指出，為延續 95 至 102 年「易淹水地區水患治理計畫」治水績效，該會參考治水經驗及整合各部會界面，於 103 年接續推動「流域綜合治理計畫」，期程共計 6 年 (103~108 年 ) ，針對縣 ( 市 ) 管區域排水及河川為對象，並結合雨水下水道、農田排水、農糧作物保全、水產養殖排水、上游坡地水土保持及治山防洪等項目，以「國土防災」、「綜合治水」、「立體防洪」、「流域治理」等面向推動流域整體治理，並加強非工程與水共存等治水之思維。
農委會表示，「流域綜合治理計畫」中的農田排水，是在行政院核定之計畫範圍內，依據流域綜合治理原則，將農田排水及設施構造物一併辦理改善，並於農業蔬菜產區如宜蘭縣三星鄉、雲林縣西螺鎮及二崙鄉、嘉義縣新港鄉及高雄市梓官區等地區，優先辦理瓶頸段排水整治，以提升農業產區保護，期能減輕洪災損失，並可降低附近社區居民財物損失及改善環境衛生，提高生活品質，具有保護人民生命安全，促進社會安寧，以及確保經濟繁榮等多元功效。